深圳市生物医学工程学会经深圳市科协批准，于1985年10月成立。是深圳市从事生物医学工程方面的医疗、科研、开发、教学和生产等科技工作者自愿结成的非营利性地方学术社会组织。旨在团结和组织本学科的科技人员专家、教授、高级工程师，积极配合有关医疗卫生部门和生产、科研、教学等企事业单位开展生物医学工程应用和理论研究，组织国内外学术交流，提高学术水平。

深圳市生物医学工程学会学会目前共有会员300余人，于2015年1月15日进行换届选举，选举了第六届理事会，共有理事58人，常务理事19人。

深圳市生物医学工程学会的宗旨是：团结和组织深圳市内生物医学工程学科的科技人员、专家、教授，积极配合有关医疗卫生部门、高校、工程中心，集研发、生产于一体的企事业单位，开展生物医学工程理论和应用的研究、组织国内外学术交流、为会员提供政府、行业的信息，沟通、会员与社会各界、会员与国外同行之间的交流，提高深圳市在生物医学工程领域内的专业水平和发展作出了贡献。